Além de intervir no tratamento das doenças comuns ao aparelho digestivo (esofágicos, gástricos, do pâncreas ou intestinais), a gastroenterologia também vem assumindo um caráter mais preventivo, como orientações no consumo de dietas mais saudáveis.

Os tratamentos na especialidade de gastroenterologia são divididos em clínicos e cirúrgicos, se debruçando também sobre tratamentos para problemas hepáticos (no fígado).