Esse revestimento por razões não totalmente esclarecidas, pode implantar-se em outros órgãos: ovários, trompas, intestinos, superfície externa e parede do útero, bexiga, peritôneo (membrana que reveste internamente os órgão pélvicos e abdominais), vagina e colo do útero. Mais raramente, pode ser encontrada ainda no fígado, cicatrizes antigas (como as de cesárea), diafragma (músculo que separa internamente a cavidade torácica da cavidade pélvica), pulmões e até cérebro.

Os focos de endométrio em locais não habituais são estimulados mês a mês devido à ação hormonal decorrente do ciclo menstrual normal e causam uma inflamação local que ocasiona dor. Inicialmente a dor é mais no período menstrual, mas progressivamente pode aumentar a frequência e por uma reação do próprio organismo contra este processo, formam-se aderências ao redor deste local, levando a sintomas mais graves como dor contínua e infertilidade.

Seus principais sintomas – e que geralmente levam a paciente a procurar um médico – são dor e dificuldade de engravidar.